飯三昧さんからの回答

分かりづらくてすみません。

ART準備中とART中のボーナス当選後は動きは同じに見えますが内部的には少し違います。

まずART準備中のボーナス当選ですが、突入リプレイ（リプリプチェ）が入賞していないためストックを使用していません。

残りストックを全て持ち越し、ボーナス終了後に発動します。

次にART中のボーナス当選ですが、ストックを1つ増やして、残りストックを全て持ち越し、ボーナス終了後に発動します。

残り連チャン数は変わりませんが、ARTで増やせる分ART中のボーナス当選の方がオトクですね。